Είναι πολύ σημαντικό να είναι καθαρός ο δίσκος από αρχεία πριν προχωρήσουμε στην εγκατάσταση των windows. Σε διαφορετική περίπτωση, είναι αποδεδειγμένο ότι ο σκληρός δίσκος αποκτάει αρκετά μεγάλα ποσοστά κατακερματισμού, κατά την διαδικασία του φορματ.
Ο κατακερματισμός των αρχείων είναι υπεύθυνος για διάφορα προβλήματα, ειδικά στους φορητούς υπολογιστές. Κατά κύριο λόγο, η ταχύτητα ανάγνωσης των αρχείων θα είναι χαμηλή. Παράλληλα, επειδή ακριβώς ο σκληρός δίσκος ταλαιπωρείται πιο πολύ για να διαβάζει τα αρχεία, ζεσταίνεται και πιο πολύ. Σε αυτό συμβάλει και ο περιορισμένος χώρος και εξαερισμός των laptop.
Όσο περισσότερα αρχεία αφήσετε μέσα στον δίσκο, τόσο σοβαρότερα προβλήματα θα έχετε στο μέλλον. Το fragmentation των αρχείων είναι αρκετές φορές μη αναστρέψιμο. Αυτό παρατηρείται κυρίως, όταν ακόμη και μετά το format του laptop, ο ελεύθερος χώρος του δίσκου είναι λιγότερος από το 35% της συνολικής χωρητικότητας του. Τα παραπάνω ισχύουν στους μηχανικούς σκληρούς δίσκους, όχι στους SSD.
Βιαστικό είναι το format όπου, κυρίως λόγω πίεσης χρόνου, τα αρχεία παραμένουν μέσα στο laptop και τα Windows εγκαθίστανται πάνω από το παλιό λειτουργικό σύστημα. Όπως προαναφέραμε, τα μειονεκτήματα είναι πολλά. Πιο σημαντικό είναι το θέμα της ασφάλειας, που περιγράφουμε παρακάτω.